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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
河南南阳新发现多处岩画 最多可达双排24连穴******
中新网郑州1月6日电 (记者 韩章云)为期两日的2022年度河南考古工作成果交流会6日持续在郑州举行，记者从交流会上获悉，河南南阳在2022年新发现了多处岩画地点，相关考古工作取得阶段性成果。
图为河南南阳境内发现的岩画。(资料图) 南阳市文物考古研究所 摄据南阳市文物考古研究所翟京襄介绍，2020年以来，南阳市文物考古研究所联合中国科学院大学、中国先秦史研究会以及岩画爱好者，对南阳地区的岩画进行了全面的考古调查。2022年新发现多处岩画地点。
图为河南南阳境内发现的岩画。(资料图) 南阳市文物考古研究所 摄2022年7月，南阳市文物考古研究所组织召开了《2022年度南阳岩石文(岩画)专家论证会》，与会专家对岩画的年代、性质等进行了广泛和深入的探讨。
图为河南南阳境内发现的岩画。(资料图) 南阳市文物考古研究所 摄翟京襄介绍，目前南阳已发现岩画遗迹点达上万处，遍布南阳大部分县区。按照岩画的形制结构、性质功用归纳为凹穴类，文字符号、线刻纹类，圆盘状类(日晷)，祭坛类，图腾类，生殖崇拜类，石洞、石屋类，巨石堆叠类共八大类。
图为河南南阳境内发现的岩画。(资料图) 南阳市文物考古研究所 摄研究发现，南阳凹穴岩画(爻窝)主要为圆形组合和线性图案。双排凹穴组合是南阳最具特色的组合形式，最多可达双排24连穴。
图为河南南阳境内发现的岩画。(资料图) 南阳市文物考古研究所 摄目前南阳发现的岩画大都刻在花岗岩和石英砂岩上，多分布在海拔较低、视线开阔的浅山丘陵地带，周围多分布有河流。制作方法大多为直接敲凿法，少数为金属工具刻凿而成。
图为河南南阳境内发现的岩画。(资料图) 南阳市文物考古研究所 摄南阳岩画分布范围广、规模大、种类多样，属中原岩画体系。通过调查，为人类早期文字、天文历法的产生，早期人类的意识形态等研究提供了全新的资料。南阳岩画的发现为探索中原史前文化，特别为中华文明探源研究提供了有力支撑。(完)
（文图：赵筱尘 巫邓炎） [责编：天天中] 阅读剩余全文（）  视觉焦点
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